简介
东京某个位于西国立市的神社内突然出现了一个戴着假面具，携着日本刀、弓箭的神秘黑影男人，三名在此密谈的可疑男子就这样毫无预警的死于这名神秘黑影男人的武器之下……事件发生的同时，大阪、东京也相继发生了可怕的杀人事件。经过警方的一番调查得知，这五名死者均系盗窃集团“源氏萤”的成员，都出没于东京、大阪、京都三地，均以偷盗著名佛像及艺术品为主。
与此同时，柯南、毛利小五郎、小兰、园子也来到了京都……原因是位于京都的某座古老寺院的住持委托小五郎来此调查一宗八年前一尊国宝级佛像遭到偷窃的案子。
沉浸在解读一幅画有佛像藏匿地点的图像中的众人突然被一个奇袭打破了寂静中的沉思。当柯南机灵的躲过袭击的瞬间却被赫然出现在眼前的男子惊住了。来者竟是与工藤新一并称为西部高中侦探的服部平次，同时他也是少数知道柯南就是新一的人物之一。此次，他之所以出现在这里，正是为了追查在大阪发生的盗窃集团成员被杀的事件。恰好，柯南与其在追查的案件似乎存在着某种联系，为了破案，一向相互较劲的两人竟然不谋而合了，当即决定联手调查……岂料，那名杀害盗窃集团成员的凶手，即那名戴着面具的神秘黑影男人竟然出现在他们面前了……